L’AERES évalue plus particulièrement les établissements contractualisés par le ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche, en vagues quadriennales A, B, C et D. Les évaluations de l’agence suivent ce cycle et sont ainsi renouvelées tous les quatre ans pour la majorité des entités évaluées, l’ensemble des évaluations étant de la même façon réparti sur cette période par campagne d’évaluation annuelle A, B, C et D.
Depuis son installation en 2007, l’AERES a réalisé les campagnes d’évaluations des établissements concernés par :
la vague D (2010-2013) : 1517 évaluations (54 établissements, 712 unités de recherche, 384 mentions de master, 296 mentions de licence et 71 écoles doctorales).
la vague C (2009-2012) : 1386 évaluations (33 établissements, 666 unités de recherche, 270 mentions de licence, 348 mentions de master, 69 écoles doctorales).
la vague B (2008-2011) : 1263 évaluations (30 établissements, 592 masters, 569 licences, 72 écoles doctorales).
Tous les rapports d’évaluation produits par l’AERES sont rendus publics sur internet, suite aux éventuelles observations transmises par l’établissement ou l’organisme.